ようやく、「ヘルプ」→「ソフトウェアの更新を確認」でもアップデートできるようになりました。
リリースノート
Firefox 3.0.1 で修正されたセキュリティの問題
関連
http://d.hatena.ne.jp/noushibou/20080626/1214443034
http://d.hatena.ne.jp/noushibou/20080619/1213833618
http://d.hatena.ne.jp/noushibou/20080619/1213834963
尚、前バージョン同様にIEのインターネットゾーン（ダウンロードするサイトが属するゾーン）のセキュリティレベルを高にしていると.exeファイルはダウンロードできません。
Firefox 3.0.1 リリース - tomcat の 落書き part-4
Firefox 3.0.1 リリース - 取締役 平社員 ブログ (ベータ版)
